Выявление новых филогенетических линий у восточноазиатской мыши на юге Сихотэ-Алиня на основе анализа изменчивости гена цитохрома b

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Проведен анализ изменчивости гена цитохрома b 11 особей восточноазиатских мышей из Уссурийского заповедника, расположенного на южных отрогах Сихотэ-Алиня в горах Пржевальского. В анализируемой популяции отмечен относительно высокий уровень генетического разнообразия за счет обнаружения особей с гаплотипами трех филогенетических линий: “Amur”, “Korea” и “Manchuria”. Большая часть особей (72.73%) в популяции имела “Amur”-гаплотипы. Отмечено, что частота особей с гаплотипами “Korea” в Уссурийском заповеднике (9.09%) значительно ниже, чем в проанализированной нами ранее популяции на самом юге Приморского края, в Хасанском районе (38.46%). В Уссурийском заповеднике впервые для территории Дальнего Востока России обнаружены две особи с гаплотипами “Manchuria”. Ранее в литературе была отмечена только одна находка особи с подобным гаплотипом в провинции Хэйлунцзян северо-востока Китая. Нами высказано предположение, что особи с гаплотипами “Korea” проникают на юг Сихотэ-Алиня из Южной Кореи, а с гаплотипами “Manchuria” – из Северо-Восточного Китая.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

В. Д. Цуканова

Федеральный научный центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии Дальневосточного отделения Российской академии наук

Email: sheremet76@yandex.ru
Россия, Владивосток, 690022

И. Н. Шереметьева

Федеральный научный центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии Дальневосточного отделения Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: sheremet76@yandex.ru
Россия, Владивосток, 690022

Список литературы

  1. Serizawa K., Suzuki H., Iwasa M. et al. A spatial aspect on mitochondrial DNA genealogy in Apodemus peninsulae from East Asia // Biochem. Genet. 2002. № 40. P. 149–161. doi: 10.1023/a:1015841424598
  2. Sakka H., Quere J.P., Kartavtseva I.V. et al. Comparative phylogeography of four Apodemus species (Mammalia: Rodentia) in the Asian Far East: Evidence of Quaternary climatic changes in their genetic structure // Biol. J. Linnean Society. 2010. V. 100. P. 797–821. doi: 10.1111/j.1095-8312.2010.01477.x
  3. Bayarlkhagva D., Tumendemberel O., Damdin B. Mitochondrial cytochrome b gene study of Apodemus peninsulae in Mongolia // Int. J. Curr. Res. 2013. V. 5. № 12. P. 3892–3896. doi: 10.13140/RG.2.2.24365.31200
  4. Шереметьева И.Н., Цуканова В.Д., Тимофеева Д.М. и др. Новые данные по распределению основных филогенетических линий восточноазиатской мыши Apodemus peninsulae на востоке России // Региональные проблемы. 2020. Т. 23. № 3. С. 10–20. doi: 10.31433/2618-9593-2020-23-3-10-20
  5. Kim H.R., Park Y.C. Genetic isolation of Korean populations of Apodemus peninsulae (Rodentia: Muridae) from their neighboring populations // Genes & Genomics. 2015. V. 37. № 12. P. 999–1005. doi: 10.1007/s13258-015-0331-0
  6. Цуканова В.Д., Шереметьева И.Н., Малыгин В.М. Изменчивость гена cyt b у восточноазиатской мыши Apodemus peninsulae Thomas, 1906 – природного носителя хантавируса AMRV в Хасанском районе Приморского края // Амурский зоол. журн. 2024. № 1. С. 56–64. https://www.doi.org/10.33910/2686-9519-2024-16-1-56-64
  7. Aljanabi S.M., Martinez I. Universal and rapid salt extraction of high quality genomic DNA for PCRbased techniques // Nucl. Aci. Res. 1997. V. 25. № 22. P. 4692–4693. doi: 10.1093/nar/25.22.4692
  8. Hall T.A. BioEdit: A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98 // Nucl. Аci. Symp. Series. 1999. V. 41. № 41. P. 95–98. doi: 10.1021/bk-1999-0734.ch008
  9. Kumar S., Stecher G., Li M. et al. MEGA X: Molecular еvolutionary genetics аnalysis across computing platforms // Mol. Biol. Evol. 2018. V. 35. № 6. P. 1547–1549. doi: 10.1093/molbev/msy096
  10. Liu X., Wei F., Li M. et al. Molecular phylogeny and taxonomy of wood mice (genus Apodemus Kaup, 1829) based on complete mtDNA cytochrome b sequences, with emphasis on Chinese species // Mol. Phylogenet. Evol. 2004. V. 33. № 1. P. 1–15. doi: 10.1016/j.ympev.2004.05.011
  11. Liu S.Y., He K., Chen S.D. et al. How many species of Apodemus and Rattus occur in China? A survey based on mitochondrial cyt b and morphological analyses // Zool. Res. 2018. V. 39. № 5. P. 309–320. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2018.053
  12. Hasegawa M., Kishino H., Yano T. Dating of the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial DNA // J. Mol. Evol. 1985. № 22. P. 160–174. doi: 10.1007/BF02101694
  13. Bandelt H.J., Forster P., Röhl A. Median-Joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Mol. Biol. Evol. 1999. V. 16. № 1. P. 37–48. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026036

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. ML-дендрограмма (а) и филогенетическая сеть гаплотипов цитохрома b мтДНК (б) восточноазиатской мыши. В узлах ветвления указаны бутстреп-поддержки, рассчитанные для 1000 повторов. Номера образцов из Уссурийского заповедника обозначены на дереве жирным шрифтом. Размеры кружков пропорциональны количеству образцов с данным гаплотипом. Цифры и риски на ветвях сети соответствуют числу нуклеотидных замен больше двух.

Скачать (407KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024