Информативность 11 микросателитных локусов для экспертной ДНК-идентификации диких и фермерских норок американских (Mustela vison) в Беларуси

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Норка американская включена в хозяйственно-экономическую деятельность Республики Беларусь, относится к ресурсным охотничьим видам, а также разводится на зверофермах для производства пушнины. Для расследования случаев незаконного промысла и хищений зверьков ради ценного меха нами предложена идентифицирующая тест-система из 11 микросателлитных локусов ДНК. Информативность тест-системы исследована на двух выборках фермерских норок и выборке из территориально удаленной от зверохозяйств дикой популяции Mustela vison. Показано, что между дикими и фермерскими норками имеются значимые генетические различия (Fst = 0.04397, P < 0.005), а вероятности случайного совпадения 11-локусных генотипов, рассчитанные с учетом и без учета коэффициента Fst, различаются на два порядка (1.84 × 10–8 и 1.39 × 10–10 соответственно). В разрезе криминалистического ДНК-анализа это требует формирования референтных баз данных для каждой из двух групп – отдельной базы для диких животных и отдельной базы для животных, разводимых в фермерских хозяйствах.

Об авторах

О. Н. Лукашкова

Научно-практический центр Государственного комитета судебных экспертиз
Республики Беларусь

Автор, ответственный за переписку.
Email: l22805@tut.by
Республика Беларусь, 220114, Минск

Е. А. Спивак

Научно-практический центр Государственного комитета судебных экспертиз
Республики Беларусь

Email: l22805@tut.by
Республика Беларусь, 220114, Минск

С. А. Котова

Научно-практический центр Государственного комитета судебных экспертиз
Республики Беларусь

Email: l22805@tut.by
Республика Беларусь, 220114, Минск

Список литературы

  1. Сидорович В.Е., Ставровский Д.Д. Норка американская // Звери: популярный энциклопедический справочник (животный мир Беларуси). Минск, 2003. С. 217–222.
  2. Министерство лесного хозяйства Республики Беларусь. Отчет о ведении охотничьего хозяйства за 2021 год. Минск, 2022. 6 с.
  3. Valnisty A.A., Homel K.V., Kheidorova E.E. et al. Molecular genetic polymorphism of American mink populations (Neovison vison) in model fur farms and on the adjacent territories in Belarus // Dokl. Natl Acad. Sci. Belarus. 2020. V. 64. № 6. P. 685–693. https://doi.org/10.29235/1561-8323-2020-64-6-685-693
  4. The Evaluation of Forensic DNA Evidence. Committee on DNA Forensic Science: an update. Washington (D.C.): Natl Acad. Press, 1996. 272 p.https://doi.org/10.17226/5141
  5. Fleming M.A., Ostrander E.A., Cook J.A. Microsatellite markers for American mink (Mustela vison) and ermine (Mustela erminea) // Mol. Ecol. 1999. V. 8. P. 1351–1362. https://doi.org/10.1046/j.1365-294x.1999.00701_2.x
  6. Vincent I.R., Farid A., Otieno C.J. Variability of thirteen microsatellite markers in American mink // Can. J. Anim. Sci. 2003. V. 83. P. 597–599. https://doi.org/10.4141/A03-001
  7. Dallas J.F., Piertney S.B. Microsatellite primers for the Eurasian otter // Mol. Ecol. 1998. V. 7. P. 1248–1250.
  8. Annavi G., Dawson D.A., Horsburgh G.J. et al. Characterization of twenty-one European badger (Meles meles) microsatellite loci facilitates the discrimination of second-order relatives // Conservation Genet. Resour. 2011. V. 3. P. 515–518. https://doi.org/10.1007/s12686-011-9392-9
  9. Rodrigues M., Santos-Reis M., Elmeros M. et al. Markers for genetic studies in the weasel (Mustela nivalis) // Eur. J. Wildl. Res. 2012. V. 58. P. 507–510. https://doi.org/10.1007/s10344-011-0583-1
  10. GeneAlEx 6.5: Genetic Analysis in Excel [Электронный ресурс]. URL: https://biology-assets.anu.edu.au/GenAlEx/Welcome.html (дата обращения 20.04.2022).
  11. Arlequin: An Integrated Software for Population Genetics Data Analysis [Электронный ресурс]. URL: http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3 (дата обращения 02.05.2022).
  12. Peakall R., Smouse P.E. GENEALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. 2006. V. 6. P. 288–295. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts460
  13. Hutchinson W.F.D., Wills D., Shipley P. MICRO-CHECKER: Software for identifying and correcting genotyping errors in microsatellite data // Mol. Ecol. Notes. 2004. V. 4. № 3. P. 535–538. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2004.00684.x
  14. Rice W.R. Analyzing tables of statistical tests // Evolution. 1989. V. 43. P. 223–225. https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1989.tb04220.x
  15. Kelly A.C., Mateus-Pinilla N.E., Douglas M. et al. Microsatellites behaving badly: empirical evaluation of genotyping errors and subsequent impacts on population studies // Genet. Mol. Research. 2011. V. 10. № 4. P. 2534–2553. https://doi.org/10.4238/2011.October.19.1
  16. Miller W.L., Edson J., Pietranrea P et al. Identification and evaluation of core microsatellite panel for use in white-tailed deer (Odocoileus virginianus) // BMC Genetics. 2019. V. 20. № 49. P. 1–14.
  17. Michalska-Parda A., Brzeziñski M., Zalewski A. et al. Genetic variability of feral and ranch American mink Neovison vison in Poland // Acta Theriologica. 2009. V. 54. P. 1–10. https://doi.org/10.1007/BF03193132
  18. Morris K.Y., Bowman J., Schulte-Hostedde A. et al. Functional genetic diversity of domestic and wild American mink (Neovison vison) // Evol. Appl. 2020. V. 13. P. 2610–2629. https://doi.org/10.1111/eva.13061
  19. Morf N.V., Kopps A.M., Nater A. et al. STRoe deer: A validated forensic STR profiling system for the European roe deer (Capreolus capreolus) // Forensic Sci. Intern.: Animals and Environments. 2021. V. 1. P. 1–10. https://doi.org/10.1016/j.fsiae.2021.100023
  20. Jobin R.M., Patterson D., Zhang Y. DNA typing in populations of mule deer for forensic use in the Province of Alberta // Forensic Sci. Intern.: Genetics. 2008. V. 2. P. 190–197. https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2008.01.003
  21. Hamlin B.C., Erin P., Meredith E.P. et al. OdoPlex: An STR multiplex panel optimized and validated for forensic identification and sex determination of North American mule deer (Odocoileus hemionus) and white-tailed deer (Odocoileus virginianus) // Forensic Sci. Intern.: Animals and Environments. 2021. V. 1. P. 11–21. https://doi.org/10.1016/j.fsiae.2021.100026
  22. Szabolcsi Z., Egyed B., Zenke P. et al. Constructing STR multiplexes for individual identification of Hungarian red deer // J. Forensic Sci. 2014. V. 59. № 4. P. 1090–1099. https://doi.org/10.1111/1556-4029.12403
  23. Rębała K., Nedzvetskaya D.E., Kotova S.A. Forensic STR typing of European elk (moose) and European roe deer reveals contrasting patterns of genetic structure of the two cervids in Belarus // Russ. J. Genet. 2022. in press.
  24. Rębala K., Rabtsava A.A., Kotova S.A. et al. STR profiling for discrimination between wild and domestic swine specimens and between main breeds of domestic pigs reared in Belarus // PLoS One. 2016. V. 11. № 11. P. 1–14. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0166563
  25. SWGDAM, Scientific Working Group on DNA Analysis Methods, Recommendations of the SWGDAM Ad Hoc Working Group on Genotyping Results Reported as Likelihood Ratios, SWGDAM, 2018. P. 1–6. https://doi.org/1ecb9588-ea6f-4feb
  26. Ogden R., Linacre A. Wildlife forensic science: A review of genetic geographic origin assignment // Forensic Sci. Intern. Genet. 2015. V. 18. P. 152–159. https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2015.02.008

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2.

Скачать (108KB)
Метаданные
3.

Скачать (168KB)
Метаданные

© О.Н. Лукашкова, Е.А. Спивак, С.А. Котова, 2023