The use of post-genomic technologies for the diagnosis of cancer on the example of prostate cancer



Cite item

Full Text

Abstract

The last ten years have significantly changed the diagnostic and therapeutic technologies in research and practice. Human genome from a large international project turns into a basis of personalized medicine. The paper presents the positive experience of the new technology experimental thinking that led to the creation of complex scientific and technological platform that allows you to significantly improve the diagnostic characteristics (sensitivity, specificity) of the traditional PSA test. This paper presents the experimental results, which can improve the specificity and sensitivity of existing diagnostic methods.

Full Text

Рак предстательной железы (РПЖ) - это гормонально зависимая опухоль, отличающаяся выраженной гетерогенностью и мультицентричным ростом, а, учитывая распространенность данного заболевания, на сегодняшний день - актуальная медико-социальная проблема. В России РПЖ занимает 2-е место после рака легкого в структуре злокачественных новообразований у мужчин. Распределение больных по стадиям: I-II стадия - 44,9%; III стадия - 35,3%; IV стадия - 17,8%; стадия не установлена - 2%. Летальность в течение года после установки диагноза 12,2% [1]. В странах с более эффективной системой выявления РПЖ показатель заболеваемости этой формой рака выше. В США с 2007 г. по настоящее время заболеваемость РПЖ на 1-м месте [2]. Успешная реализация международного проекта «Геном человека» (International Human Genome Sequencing Consortium 2001) привела к формированию в начале XXI века нескольких новых научных дисциплин (геномики, транскриптомики, протеомики, биоинформатики и др.), а также к внедрению в различные молекулярные исследования современных высокоэффективных технологий, предназначенных для изучения генов человека и кодируемых ими белков, пептидов и их метаболитов. Все это позволяет говорить о переходе биомедицинских дисциплин в постгеномную эру развития, что дает возможность проводить поиск более эффективных маркеров различных заболеваний человека, в том числе и онкологических. Перспективы улучшения результатов лечения связаны с ранней диагностикой предраковых изменений и опухолевого процесса в предстательной железе. Сегодня известно более 220 биохимических маркеров РПЖ. До недавнего времени (с 1979 г.), счита- Таблица 1 Критерии аналитической надежности ПСА-теста и его производных в сравнении с клиническими методами обследования Чувствительность,% Специфичность,% ПСАобщ. 95 13 ПСАсвоб. 95 17 -2проПСА 95 33 Phi 90 34,8 РСА3 67 83 ТРУЗИ 69,4 92,2 ПРИ 55,7 95,7 Примечание. ТРУЗИ - трансректальное ультразвуковое исследование. ПРИ - пальцевое ректальное исследование. лось, что проблему точной диагностики РПЖ решает анализ уровня так называемого простатоспецифического антигена (ПСА) [3], однако существуют убедительные данные о недостаточной диагностической значимости этого маркера [4-7]. Показано, что около 40% пациентов с нормальным уровнем ПСА имеют клинически выраженный РПЖ [8, 9], тогда как у 65% лиц с повышенным уровнем ПСА (выше 4 нг/мл) оказываются иные заболевания предстательной железы, в частности доброкачественная гиперплазия и воспаление [4]. В связи с этим в мире активно проводится поиск новых, более эффективных маркеров РПЖ [6, 10-12] и одно из центральных мест в этом занимают работы, проводимые с помощью различных постгеномных и, в частности, геномных, и про- теомных технологий [13, 14]. Ранняя диагностика в таких случаях возможна на уровне оценки предрасположенностей к РПЖ в зависимости от генотипа однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП, SNP's) в онкогенах и генах опухолевой супрессии [10, 13, 15] и основывается на анализе серой зоны ПСА крови (2,5-4 нг/мл), когда принимается решение о выполнении биопсии простаты. Известно, что 35-45% пациентов с уровнем ПСА более 10 нг/мл получают отрицательный результат биопсии. По другим данным, 63% пациентов с аденокарциномой предстательной железы (при показателе Глисона > 7) имеют уровень ПСА менее 3 нг/мл. Целевой функцией применения ПСА-теста в скрининге является снижение смертности от РПЖ. В Европейском Союзе и США проведены два масштабных исследования по скринингу РПЖ. Результаты Европейского рандомизированного исследования (ERSPC) демонстрируют снижение специфической выживаемости скрининговой группы на 21% по сравнению с контрольной группой за 11 лет наблюдения, на 44% - за 14 лет наблюдения. Данное исследование доказало эффективность ПСА-теста в скрининге РПЖ, при большем периоде наблюдения возрастает результативность скрининга [10, 15]. Федеральные регуляторные органы при правительстве США подготовили новые рекомендации, согласно которым здоровые мужчины перестанут проходить регулярные анализы на ПСА для раннего выявления РПЖ. Основанием такого решения явились результаты мультицентрового контролируемого клинического исследования (PLSO), которые продемонстрировали неэффективность ПСА-теста для скрининга РПЖ: не снижается общая смертность от этого заболевания, гипердиагностика приводит к ряду необоснованных диагностических и лечебных мероприятий (биопсии предстательной железы), ассоциированных с высоким риском осложнений. Данное положение объясняется низким уровнем канце- роспецифичности ПСА-теста (табл. 1) [16]. В изучении и разработке биологических маркеров РПЖ на сегодняшний день сформировались следующие направления: 1. Дальнейшее изучение клинического применения ПСА крови и его производных (-2проПСА; ПСА- общ.,, ПСАсвоб.,, время удвоения ПСА; плотность ПСА и т. д.); 2. Дальнейший клинико-лабораторный поиск диагностических маркеров и их клиническая валидация (Аннексин III (ANXA3, Annexin A3), PCA3 (Prostate cancer antigen 3) и другие), обладают большей чувствительностью и специфичностью, чем ПСА; 3. Активное применение постгеномных технологий для более тонкой (выше чувствительность и специфичность) работы с существующими маркерами и разработка новых диагностических алгоритмов. Наглядной демонстрацией интеграции пост- геномных технологий в клинику является работа Robert K. Nam и его коллег, выполненная в Канадском институте исследования здоровья [6]. В данной работе проведено обследование 3004 мужчин (из них РПЖ у 1389 (46,2%)) на 25 генетических полиморфизмах. Проведена биопсия предстательной железы и сделана попытка на основании стандартного общеклинического и генетического обследования определить персональную норму ПСА-теста (индивидуальная норма ПСА-теста с учетом генетической предрасположенности конкретного пациента). Результаты и обсуждение В результате выделено 7 полиморфизмов (табл. 2), ассоциирующих уровень ПСА крови с результатами гистологического исследования после пункционной биопсии предстательной железы. Анализ полученных данных показывает, что у более 5% (1-я группа) выборки распространено генетически детерминированное повышение уровня ПСА крови более чем на 23-47%, чем средний уровень в популяции. У 5% пациентов (2-я группа) отмечается генетически детерминированное снижение уровня ПСА крови на 30-56%, чем средний уровень в популяции. В представленной выборке, группе кровных родственников (3-я группа, более 5%), отмечается повышение значения ПСА крови на 40-92%. Вместе тем, отмечается депривация показателя ПСА на 53-80% в 4-й группе, кровных родственников (более 5%), чем среднее статистическое значение в популяции. Полученные данные демонстрируют влияние четырех полиморфизмов на уровень ПСА крови и показывают корреспонденцию индивидуальную и общепринятого значения в популяции (сut-off value 4 ng/ml). Вместе с тем при расчете показателей нормы (сШ> off values) c учетом индивидуальной специфичности: 1-я группа: 4,9-5,9 нг/мл; 2-я группа: 5,6-7,7 нг/мл; 3-я группа: 1,7-2,8 нг/мл; 4-я группа: 0,8-1,9 нг/мл. Таблица 2 Панель полиморфизмов (SNPs), выбранных для анализа и сравнения частот аллелей между исследуемой и контрольной группами SNP Аллель /генотип риска Ген Хромосома Частота положительных биопсий Частота отрицательных биопсий Риск РПЖ (Odds Ratio 95% CI) rs2736098 A 5p15.33 5 0,34 0,32 1,04 (0,94-1,16) rs10993994 T 10q11 10 0,41 0,40 1,05 (0,96-1,15) rs10788160 A 10q26 10 0,28 0,32 0,79 (0,71-0,87) rs11067228 А 12q24 12 0,55 0,59 0,87 (0,79-0,95) rs4430796 A 17q12 17 0,55 0,53 1,03 (0,97-1,10) rs17632542 T 19q13.33 19 0,93 0,95 0,77 (0,63-0,95) rs2735839 G KLK3 19 0,88 0,89 0,85 (0,74-0,98) Проведенный анализ свидетельствует, что обладатели трех полиморфизмов 10q26, 12q24, и 19q13.33 ассоциированы с повышением уровня ПСА крови, другие 4 аллеля ассоциированы с повышенным риском РПЖ. Определение персонального уровня ПСА крови (cut-off value) с учетом генотипа пациента является существенным индикатором при определении показания для выполнения пункционной биопсии предстательной железы, интерпретации результатов и определения тактики ведения пациента в послеоперационном периоде. При инкорпорировании в нормограмму генотипического статуса вместе со значением ПСА семейного анамнеза, этнического происхождения, данных шкалы IPSS, возраста и пальцевого ректального исследования возрастает позитивная положительная ценность ПСА-теста от 42 до 94% и мультифокальной пункционной биопсии предстательной железы соответственно. Таким образом, созданная научно-практическая модель геномно-протеомной системы позволит выделить группу риска по РПЖ из наблюдаемой популяции и организовать диспансеризацию с индикаторами контроля качества. В клинической практике данная технология молекулярной биологии позволит онкологу, урологу осуществлять лечебный менеджмент, а не только констатировать факт заболевания у пациента. Выводы 1. Постгеномные технологии не являются сменой существующих геномных, а являются их дальнейшим логическим эволюционным развитием. 2. Применение генотипирования пациентов с риском РПЖ увеличивает положительную прогностическую и диагностическую ценность ПСА-теста и помогает определить целесообразность и оптимальное время проведения пункционной биопсии предстательной железы под УЗ-контролем. 3. Интеграция в клиническую практику посте- геномных технологий позволит более эффективно использовать существующие диагностические тест- системы, такие как ПСА и другие. 4. В настоящее время мы находимся в начале нового этапа эволюционного развития в лабораторной медицине. Будущее будет принадлежать разработке и внедрению в клиническую практику мультипара- метрических биологических платформ (профилей) заболевания. 5. «Платформенный» формат исследования позволит специалистам лабораторной диагностики более детально (на молекулярном уровне) оценивать патологические процессы при мультифакторных заболеваниях. Клиницисты получают инструменты лечебного менеджмента заболевания, которые позволят прогнозировать риски развития, распространенность и агрессивность опухолевого процесса на доклинической и ранней стадии заболевания, а не только констатировать состоявшийся факт наличия патологии.
×

About the authors

Maksim N. Peshkov

Scientific Research Institute of Physical-Chemical Medicine

Email: Drpeshkov@gmail.com
MD, PhD 119435, Moscow, Russian Federation

E. I Sharova

Scientific Research Institute of Physical-Chemical Medicine

119435, Moscow, Russian Federation

I. D Klabukov

Scientific Research Institute of Physical-Chemical Medicine

119435, Moscow, Russian Federation

References

  1. Чиссов В.И., Старинский В.В., Петрова Г.В., ред. Злокачественные новообразования в России в 2010 г. (заболеваемость и смертность). М.: ФГБУ «МНИОИ им. П. А. Герцена» Минздравсоцразвития России. 2012.
  2. Jemal A., Bray F., Center M. M. et al. Global cancer statistics. CA. Cancer J. Clin. 2011; 61(2): 69-90.
  3. Wang M.C., Valenzuela L.A., Murphy G.P, Chu T.M. Purification of a human prostate specific antigen. Invest. Urol. 1979; 17: 159-63.
  4. Catalona W.J., Partin A.W., Slawin K.M., Brawer M., Flanigan R., Patel A. et al. Use of the percentage of free prostate-specific antigen to enhance differentiation of prostate cancer from benign prostatic disease: a prospective multicenter clinical trial. J. A. M. A. 1998; 279 (19): 1542-7.
  5. Catalona W.J., Smith D.S., Ratliff T.L., Basler J.W. Detection of organ-confined prostate cancer is increased through prostate-specific antigen-based screening. J. A. M. A. 1993; 270 (8): 948-54.
  6. Nam R.K., Zhang W.W., Trachtenberg J., Seth A., Klotz L.H., Stanimirovic A. et al. Utility of incorporating genetic variants for the early detection of prostate cancer. Clin. Cancer Res. 2009; 15(5): 1787-93.
  7. Schaefer A., Jung M., Mollenkopf H.J., Wagner I., Stephan C. , Jentzmik F. et al. Diagnostic and prognostic implications of microRNA profiling in prostate carcinoma. Int. J. Cancer. 2010; 126(5): 1166-76.
  8. Stamey T.A., Caldwell M., McNeal J.E., Nolley R., Hemenez M, Downs J. The PSA era in the United States is over for prostate cancer: what happened in the past 20 years? J. Urol. 2004; 172(4): 1297-301.
  9. Thompson I.M., Ankerst D.P., Chi C., Goodman P.J., Tangen C. M., Lucia M.S, et al. Assessing prostate cancer risk: results from the Prostate Cancer Prevention Trial. J. Natl. Cancer Inst. 2006; 98(8): 529-34.
  10. Schroder F.H., Hugosson J., Roobol M.J., Tammela T.L., Ciatto S., Nelen V., et al. Screening and prostate cancer mortality in a randomized European study. N. Engl. J. Med. 2009; 360(13): 1320-8.
  11. Stephenson A.J., Scardino P.T., Eastham J. A., Bianco F.J., Dotan Z.A., Fearn P. A. et al. Preoperative nomogram predicting the 10-year probability of prostate cancer recurrence after radical prostatectomy. J. Nat. Cancer Inst. 2006; 98(10): 715-7.
  12. Zheng S.L., Sun J., Wiklund F., Smith S., Stattin P., Li G. et al. Cumulative association of five genetic variants with prostate cancer. N. Engl. J. Med. 2008; 358, 910-19.
  13. Cheville J.C., Karnes R.J., Therneau T.M., Kosari F., Munz J.- M., Tillmans L. et al. Gene panel model predictive of outcome in men at high-risk of systemic progression and death from prostate cancer after radical retropubic prostatectomy. J. Clin. Oncology. 2008; 26(24): 3930-6.
  14. Koh C.M., Bieberich C.J., Dang C.V., Nelson W.G., Yegnasubramanian S., De Marzo A.M. MYC and prostate cancer. Genes and Cancer. 2010; 1(6): 617-28.
  15. Andriole G.L., Crawford E.D., Buys S.S., Grubb R.L. III et al. Mortality results from a randomized prostate-cancer screening trial. N. Engl. J. Med. 2009; 360: 1310-9.
  16. Schroder F.H., Hugosson J., Roobol M.J. Screening and prostate-cancer mortality in a randomized European study. N. Engl. J. Med. 2009; 360: 1320-8.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2015 Eco-Vector


СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС 77 - 86496 от 11.12.2023 г. 
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ЭЛ № ФС 77 - 80673 от 23.03.2021 г.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies